Fenerbahçe Üniversitesi İstanbul’un merkezi Ataşehir’de, ulaşım açısından son derece kolay bir güzergâh üzerinde yer almaktadır. Kadıköy, Bostancı ve Sabiha Gökçen Havalimanı’ndan toplu taşıma araçları kullanılarak kolaylıkla ulaşım sağlanabilmektedir. Kadıköy, Bostancı ve İstanbul Sabiha Gökçen Uluslararası Havalimanı’ndan Üniversitemize ulaşım aşağıda belirtilmektedir.

• Hızlı Tren ile Ulaşım: YHT (Yüksek Hızlı Tren) ile ulaşım için Bostancı ve Söğütlüçeşme durakları üzerinden sağlanabilmektedir.
  - Söğütlüçeşme durağından 14ŞB İETT otobüs hattına aktarma yapılarak Ataşehir Atatürk Mahallesi durağı üzerinden ulaşım sağlanabilmektedir.
  - Bostancı durağından 10 İETT otobüs hattı kullanılarak Ataşehir durağı üzerinden ulaşım sağlanabilmektedir.
  - M8 Bostancı-Parseller Metro Hattı ile Mevlana Metro Durağı’na gelinerek 19E, 14ŞB, 13FY İETT otobüs hatları kullanılarak Ataşehir Atatürk Mahallesi durağı üzerinden ulaşım sağlanabilmektedir.
  
• Kadıköy’den Ulaşım: Kadıköy’den 19EK, 14ŞB İETT Otobüs Hatları kullanılarak Ataşehir Atatürk Mahallesi durağı üzerinden ulaşım sağlanabilmektedir.
• Bostancı’dan Ulaşım: Bostancı durağından 10 İETT Otobüs Hattı kullanılarak Ataşehir durağı üzerinden ulaşım sağlanabilmektedir.
  M8 Bostancı-Parseller Metro Hattı ile Mevlana Metro Durağı’na gelinerek 19E, 14ŞB, 13FY İETT Otobüs Hatlar kullanılarak Ataşehir Atatürk Mahallesi durağı üzerinden ulaşım sağlanabilmektedir.
• İstanbul Sabiha Gökçen Uluslararası Havalimanı’ndan Ulaşım: M4 Kadıköy-Sabiha Gökçen Havalimanı Metro Hattı ile Sabiha Gökçen Havalimanı durağından binildiğinde Pegasus-Kozyatağı Metro Durağı’ndan 19E İETT otobüs hattına aktarma yaparak Ataşehir Atatürk Mahallesi durağı üzerinden ulaşım sağlanabilmektedir.